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Long Noncoding RNA High Expression in Hepatocellular Carcinoma Facilitates Tumor Growth Through Enhancer of Zeste Homolog 2 in Humans
日期:2016-04-19 標(biāo)簽:lncRNA-HEIH,EZH2
lncRNA HEIH與蛋白EZH2互作
文章研究思路
核心Figure
Figure說明:Figure主要闡述的是lncRNA HEIH與蛋白EZH2的相互作用。A:RIP實(shí)驗(yàn)。利用EZH2抗體,在Huh-7細(xì)胞和HCCLM3細(xì)胞中,釣取與蛋白EZH2結(jié)合的lncRNA,qPCR檢測,結(jié)果證實(shí)蛋白EZH2與lncRNA HEIH有相互作用(Ab-1和Ab-2為lncRNA HEIA的兩個(gè)檢測位點(diǎn))。B:將A圖結(jié)果數(shù)據(jù)化。 C:利用RIP實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證蛋白actin和AK055007與lncRNA HEIA無相互作用,作為A圖對(duì)照。D:作為A圖的反向驗(yàn)證,用RNA pull down驗(yàn)證lncRNA HEIH與蛋白EZH2有相互作用。E:利用RNA pull down進(jìn)一步驗(yàn)證蛋白EZH2與 lncRNA HEIH結(jié)合區(qū)域。
我們公司可以提供的技術(shù)服務(wù)
一、RIP
RIP(RNA 免疫共沉淀)技術(shù),主要--研究蛋白與RNA的相互作用,主要原理是利用特定的蛋白抗體,在全蛋白提取液中捕獲特定蛋白,特定蛋白含有與之結(jié)合的RNA,洗脫RNA,反轉(zhuǎn)錄,qPCR檢測。我公司在實(shí)驗(yàn)體系中設(shè)置陽性及陰性對(duì)照,進(jìn)一步排除系統(tǒng)誤差。
二、RNA pull down
RNA pull down技術(shù),主要研究lncRNA與蛋白的相互作用,主要原理是體外轉(zhuǎn)錄生物素標(biāo)記的RNA,標(biāo)記有生物素的RNA吸附到鏈霉親和磁珠上,RNA與全蛋白提取液孵育,捕獲互作的蛋白,后續(xù)進(jìn)行銀染-質(zhì)譜或Western檢測。我公司在實(shí)驗(yàn)體系中同時(shí)提供lncRNA正義鏈與反義鏈的pull down。
三、預(yù)測lncRNA與蛋白互作位點(diǎn)
通過相關(guān)的預(yù)測軟件預(yù)測lncRNA的結(jié)合位點(diǎn),根據(jù)結(jié)合位點(diǎn)設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案,利用RNA pull down實(shí)驗(yàn),進(jìn)一步驗(yàn)證蛋白與lncRNA的結(jié)合區(qū)域。
原文鏈接:Long Noncoding RNA High Expression in Hepatocellular Carcinoma Facilitates Tumor Growth Through Enhancer of Zeste Homolog 2 in Humans (提取碼:21b3)
來源:360云盤
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