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1.4. 高級分析系列

1.4.1. chip-seq的結(jié)果定量與比較

如何對 chip-seq 的結(jié)果定量？ Chip seq的定量與比較（Diffbind）告訴了我們什么信息？

原理概述： 我們是如何計算定量結(jié)果與差異Peak的？

分析案例： Chip差異Peak分析結(jié)果及報告

1.4.2. RNA-seq 和 Chip-seq 的聯(lián)合分析

RNA-seq 和 Chip-seq 的聯(lián)合分析

• 意義在于尋找轉(zhuǎn)錄水平變化的根本原因，從表觀水平的變化去解釋。

• “RNA seq 和 組蛋白Chip 聯(lián)合分析” 與 “RNA seq 和 轉(zhuǎn)錄因子Chip 聯(lián)合分析” 分析流程相同，不同在于得到結(jié)果的意義。

1.4.3. CRC分析

CRC分析能給出什么信息？

• CRC（Core transcription regulatory circuitry ）：核心調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析

• 通過調(diào)控網(wǎng)絡(luò)關(guān)系分析，可以從SEs中通過找到的核心影響轉(zhuǎn)錄因子。助力精確定位核心轉(zhuǎn)錄因子

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• 1 . ChIP-seq
  • 1.1. ChIP-seq可以告訴我們什么信息
  • 1.2. TF-chip與Histonechip
  • 1.3. superenhancer的分析
  • 1.4. 高級分析
• 2 . RNA-seq
  • 2.1. RNA-seq能告訴我們一些什么信息
  • 2.2. mRNA建庫，分析
  • 2.3. ncRNA seq
  • 2.4. go與kegg的意義與David網(wǎng)站