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長鏈非編碼RNA（Long non-coding RNA，lncRNA）是一類本身不編碼蛋白，長度在200-100000 nt之間的RNA分子。它可在多層面上（表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等）調(diào)控基因的表達。lncRNA最初被認為是RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄的副產(chǎn)物，是一種“噪音”，不具有生物學功能。研究表面，lncRNA參與了X染色體沉默、染色體修飾和基因組修飾、轉(zhuǎn)錄激活、轉(zhuǎn)錄干擾、核內(nèi)運輸?shù)冗^程，其調(diào)控作用正在被越來越多的人研究。

LncRNA可分為五類：Antisense lncRNA（反義長非編碼RNA），Intronic transcript （內(nèi)含子非編碼RNA），Large intergenic noncoding RNA（lincRNA），Promoter-associated lncRNA（啟動子相關(guān)lncRNA）以及UTR associated lncRNA（非翻譯區(qū)lncRNA）。

哺乳動物蛋白編碼基因占總RNA的1%，長鏈非編碼RNA占總RNA的比例可達4%-9%，這些長鏈非編碼RNA是基因功能研究的又一座寶庫。目前發(fā)現(xiàn)的許多lncRNA都具有保守的二級結(jié)構(gòu)，一定的剪切形式以及亞細胞定位。它們在基因組上相對于蛋白編碼基因的位置，可以分為5種：正義鏈（sense）、反義鏈（antisense）、雙向（bidirectional）、內(nèi)含子間（intronic）、基因間（intergenic），其所在的位置與其功能有一定的相關(guān)性。

圖1 不同位置lncRNA示意圖

LncRNA具有以下特點：

1 lncRNAs通常較長，具有mRNA樣結(jié)構(gòu)，經(jīng)過剪接，具有polyA尾巴與啟動子結(jié)構(gòu)，分化過程中有動態(tài)的表達與不同的剪接方式。

2 有組織特異性與時空特異性，不同組織之間的lncRNA表達量不同，同一組織或器官在不同生長階段，其中的lncRNA表達量也會變化。

3 調(diào)控多樣性，lncRNA可從染色質(zhì)重塑、轉(zhuǎn)錄調(diào)控及轉(zhuǎn)錄后加工等多種層面實現(xiàn)對基因表達的調(diào)控。lncRNAs啟動子同樣可以結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子，如Oct3/4，Nanog, CREB, Sp1, c-myc, Sox2與p53，局部染色質(zhì)組蛋白同樣具有特征性的修飾方式與結(jié)構(gòu)特征。

4 序列上保守性較低，只有約12%的lncRNA可在人類之外的其它生物中找到。

5 在腫瘤與其他疾病中有特征性的表達方式。

• 1 . miRNA的概述
  • 1.1. miRNA的生物發(fā)生
  • 1.2. miRNA的作用機制
  • 1.3. miRNA的研究展望
  • 1.4. miRNA與癌癥
  • 1.5. miRNA在轉(zhuǎn)化醫(yī)學中的應用
• 2 . lncRNA的概述
  • 2.1. lncRNA的研究背景
  • 2.2. lncRNA的作用機制
  • 2.3. lncRNA的研究展望
  • 2.4. lncRNA與癌癥
  • 2.5. lncRNA與臨床疾病
• 3 . miRNA與lncRNA研究策略
  • 3.1. miRNA的一般研究策略
  • 3.2. AGO2在miRNA研究中的應用
  • 3.3. LncRNA的一般研究策略
  • 3.4. miRNA與lncRNA的生物信息學預測
• 4 . miRNA與lncRNA研究實驗
  • 4.1. RNA 結(jié)合蛋白免疫沉淀技術(shù)（RIP）Model Figures
  • 4.2. RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀技術(shù)（RIP）實驗流程
  • 4.3. RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀技術(shù)（RIP）實驗常見問題
  • 4.4. RNA pull - down Model Figures
  • 4.5. RNA pull- down實驗流程
  • 4.6. RNA pull- down實驗常見問題
  • 4.7. 熒光素酶檢測技術(shù)（Luciferase）Model Figures
  • 4.8. 熒光素酶檢測技術(shù)（Luciferase）實驗流程
  • 4.9. 熒光素酶檢測技術(shù)（Luciferase）實驗常見問題