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RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀技術(shù) RIP

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實(shí)驗(yàn)技術(shù)流程

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實(shí)驗(yàn)常見問題

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結(jié)果分析

      對(duì)于一幅RIP-qRT-PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果Figure,應(yīng)包含位點(diǎn)作用示意圖、qRT-PCR結(jié)果數(shù)據(jù)分析圖,并應(yīng)在Supplement中補(bǔ)充相關(guān)的驗(yàn)證性實(shí)驗(yàn)圖片,具體如下圖所示。

RIP model figure

      RNA與蛋白綁定結(jié)合位點(diǎn)。經(jīng)過一定處理,RNA原本以雙鏈莖環(huán)結(jié)構(gòu),不結(jié)合RBP蛋白和miRNA,經(jīng)過處理后莖環(huán)結(jié)構(gòu)打開,一條鏈結(jié)合RBP,另外一條鏈結(jié)合miRNA和RISC。

 

      Figure A:

      某基因的引物設(shè)計(jì)位點(diǎn)。

RIP model figure A


      Figure B:

      上圖:RNA結(jié)合蛋白,與未處理(Mock)組比較經(jīng)過處理(Treat)后位點(diǎn)1、2結(jié)合量明顯大量增加;下圖:RBP IP組,陰性對(duì)照組Mock IgG IP,陽性對(duì)照組SNRNP70 IP。

RIP model figure B


      Supplement:

      WB檢測(cè)RNA結(jié)合蛋白的表達(dá)。

RIP model figure S.A

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