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實(shí)驗(yàn)相關(guān)產(chǎn)品

實(shí)驗(yàn)技術(shù)流程

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實(shí)驗(yàn)常見(jiàn)問(wèn)題

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結(jié)果分析

對(duì)于一幅ChIP-qPCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果Figure，應(yīng)包含位點(diǎn)作用示意圖、qPCR結(jié)果數(shù)據(jù)分析圖，并應(yīng)在Supplement中補(bǔ)充相關(guān)的驗(yàn)證性實(shí)驗(yàn)圖片，具體如下圖所示。

     Figure A：

      未處理組（Mock）與處理組（Treat）RNA聚合酶II分別與目的基因啟動(dòng)子調(diào)控區(qū)域A區(qū)域、D區(qū)域、G區(qū)域的結(jié)合。處理后RNA聚合酶II與A區(qū)域、G區(qū)域結(jié)合明顯增加，D區(qū)域結(jié)合情況未有明顯變化。

      Figure B：

      未處理組（Mock）與處理組（Treat）轉(zhuǎn)錄因子1（TF1）分別與目的基因啟動(dòng)子調(diào)控區(qū)域A區(qū)域、B區(qū)域、C區(qū)域、D區(qū)域、E區(qū)域、F區(qū)域、G區(qū)域、H區(qū)域、I區(qū)域的結(jié)合情況比較。未處理組（Mock）：轉(zhuǎn)錄因子1（TF1）與目的基因啟動(dòng)子調(diào)控區(qū)域A、B、G、H有結(jié)合，但與D、E、I區(qū)域有不明顯的少量結(jié)合，且與C、F組不結(jié)合。處理組（Treat）：轉(zhuǎn)錄因子1(TF1)與目的基因啟動(dòng)子調(diào)控區(qū)域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有結(jié)合，且與A、B、G、H區(qū)域的結(jié)合經(jīng)處理后明顯的大量提升，且原本不結(jié)合的C、F區(qū)域處理后有少量結(jié)合，對(duì)D、E、I區(qū)域的結(jié)合情況無(wú)明顯改變。

      Figure C：

      未處理組（Mock）與處理組（Treat）轉(zhuǎn)錄因子2（TF2）分別與目的基因啟動(dòng)子調(diào)控區(qū)域A區(qū)域、B區(qū)域、C區(qū)域、D區(qū)域、E區(qū)域、F區(qū)域、G區(qū)域、H區(qū)域、I區(qū)域的結(jié)合情況。未處理組（Mock）：轉(zhuǎn)錄因子2（TF2）與目的基因啟動(dòng)子調(diào)控區(qū)域G、H有明顯結(jié)合，與A、B、C、I區(qū)域有少量的結(jié)合，且與D、F組不結(jié)合。處理組（Treat）：轉(zhuǎn)錄因子2(TF2)與目的基因啟動(dòng)子調(diào)控區(qū)域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有結(jié)合，且與A、B、G、H區(qū)域的結(jié)合經(jīng)處理后明顯的大量提升，且與C、I區(qū)域的結(jié)合經(jīng)處理后也有提升，與且原本不結(jié)合的D、F區(qū)域處理后有少量結(jié)合，對(duì)E區(qū)域的結(jié)合情況無(wú)改變。

      Figure D：

      未處理組（Mock）與處理組（Treat）轉(zhuǎn)錄因子2（TF2）分別與目的基因啟動(dòng)子調(diào)控區(qū)域Chr1.3q4（1號(hào)染色體3q4座位）的區(qū)域：A區(qū)域、B區(qū)域、C區(qū)域、D區(qū)域、E區(qū)域、F區(qū)域、G區(qū)域、H區(qū)域、I區(qū)域的結(jié)合情況。未處理組（Mock）：H3K7Ac（3號(hào)組蛋白7號(hào)賴(lài)氨酸位點(diǎn)乙?；揎椀鞍祝┡c目的基因啟動(dòng)子調(diào)控區(qū)域A,B C G、H有明顯結(jié)合，與D、E、F、I區(qū)域有少量的結(jié)合。處理組（Treat）：H3K7Ac（3號(hào)組蛋白7號(hào)賴(lài)氨酸位點(diǎn)乙?；揎椀鞍祝┡c目的基因啟動(dòng)子調(diào)控區(qū)域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有結(jié)合，且與A、B、C、G、H、I區(qū)域的結(jié)合經(jīng)處理后明顯的大量提升，且與D、E區(qū)域的結(jié)合經(jīng)處理后也有少量提升。

      Supplement：

      A 預(yù)實(shí)驗(yàn)：WB檢測(cè)轉(zhuǎn)錄因子在細(xì)胞核內(nèi)表達(dá)

      B 細(xì)胞核抽提物被經(jīng)過(guò)超聲波打斷或核酸酶酶解后DNA電泳，表示基因組DNA被打斷成500bp左右的片段，方便后續(xù)的免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)。

      C ChIP-qPCR實(shí)驗(yàn)后，體系內(nèi)的DNA片段擴(kuò)增物進(jìn)行DNA電泳，檢測(cè)qPCR擴(kuò)增產(chǎn)物是否和設(shè)計(jì)相符，以及檢測(cè)是否有引物二聚體產(chǎn)生影響實(shí)驗(yàn)。

• 1 . 基因表達(dá)調(diào)控概述
  • 1.1. 轉(zhuǎn)錄調(diào)控與轉(zhuǎn)錄激活
  • 1.2. 轉(zhuǎn)錄后調(diào)控
  • 1.3. miRNA與lncRNA
• 2 . 基因表達(dá)調(diào)控研究進(jìn)展
• 3 . 基因表達(dá)調(diào)控研究方法
• 4 . 基因表達(dá)調(diào)控主要實(shí)驗(yàn)技術(shù)
  • 4.1. 染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù) ChIP
  • 4.2. RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀技術(shù) RIP
  • 4.3. RNA pull-down
  • 4.4. DNA pull-down
  • 4.5. 熒光素酶檢測(cè)技術(shù) Luciferase
  • 4.6. 凝膠遷移/電泳遷移率實(shí)驗(yàn) EMSA