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>>miRNA與lncRNA研究策略專題
>>miRNA與lncRNA研究實(shí)驗(yàn)
>>RNA pull- down實(shí)驗(yàn)常見問題
RNA pull- down實(shí)驗(yàn)常見問題
問題1:RNA 降解
可能原因:1)無核酸酶的環(huán)境被破壞
2)體外轉(zhuǎn)錄的RNA探針降解
解決辦法:1)清洗和使用新開的離心管和試劑等
2)RNA探針合成后,電泳檢測其長度和濃度
問題2:RNA結(jié)合蛋白的親和力不夠:
可能原因:1)結(jié)合緩沖環(huán)境沒有優(yōu)化
2)裂解不完全
3)磁珠用量不足
4)RNA探針用量不足
解決辦法:1)優(yōu)化孵育時間、溫度 、鹽濃度等條件
2)增加裂解液和蛋白上樣量的比例
3)增加裂解液
4)增加磁珠用量
5)增加探針用量
6)確定生物素和鏈霉親和素效率
問題3:RNA結(jié)合蛋白沒有結(jié)合
可能原因:1)靶蛋白量不足
2)緩沖體系不對
3)RNA探針和蛋白的親和力本來就低
解決辦法:1)增加上樣蛋白量
2)應(yīng)用低鹽體系
3)加入交聯(lián)試劑
問題4:結(jié)合的非特異性高
可能原因:1)緩沖環(huán)境沒有優(yōu)化
2)緩沖環(huán)境嚴(yán)謹(jǐn)性低
3)樣品沒有裂解完全和裂解體系沒有優(yōu)化
解決方法:1)優(yōu)化孵育時間溫度 鹽濃度等條件
2)使用嚴(yán)謹(jǐn)性高的緩沖體系
3)調(diào)低RNA探針和樣品的比例
4)提高裂解液的量
問題5:WB信噪比高
可能原因:1)陽性信號率低
2)一抗效率低
3)蛋白沒有充分溶解
解決方法:1)增加二抗的量
2)用敏感度的化學(xué)發(fā)光液
3)用細(xì)胞裂解液預(yù)孵一抗
4)增加樣品的量
5)確定有沒有其他可能的結(jié)合情況
6)增加裂解液用量
目錄瀏覽
- 1 . miRNA的概述
- 2 . lncRNA的概述
- 3 . miRNA與lncRNA研究策略
- 4 . miRNA與lncRNA研究實(shí)驗(yàn)
- 4.1. RNA 結(jié)合蛋白免疫沉淀技術(shù)(RIP)Model Figures
- 4.2. RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀技術(shù)(RIP)實(shí)驗(yàn)流程
- 4.3. RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀技術(shù)(RIP)實(shí)驗(yàn)常見問題
- 4.4. RNA pull - down Model Figures
- 4.5. RNA pull- down實(shí)驗(yàn)流程
- 4.6. RNA pull- down實(shí)驗(yàn)常見問題
- 4.7. 熒光素酶檢測技術(shù)(Luciferase)Model Figures
- 4.8. 熒光素酶檢測技術(shù)(Luciferase)實(shí)驗(yàn)流程
- 4.9. 熒光素酶檢測技術(shù)(Luciferase)實(shí)驗(yàn)常見問題