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項(xiàng)目名稱:基因芯片聚類分析

所屬分類:DNA分析

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技術(shù)服務(wù)描述

基因表達(dá)數(shù)據(jù)主要來自于兩個(gè)方面:(1)基因芯片,這是最主要的表達(dá)數(shù)據(jù)來源,利用基因芯片技術(shù)可以大規(guī)模并行獲取基因轉(zhuǎn)錄結(jié)果mRNA的數(shù)據(jù);(2)表達(dá)系列分析SAGE和差異顯示、蛋白質(zhì)芯片等是快速檢測(cè)蛋白質(zhì)及其含量的另一類技術(shù)。

通過分析基因表達(dá)數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)與疾病直接相關(guān)的基因,以及發(fā)現(xiàn)這些基因的活動(dòng)規(guī)律。

聚類分析是模式識(shí)別中一種非常有吸引力的方法,特別適用于模式分類數(shù)不知道的情況?;虮磉_(dá)數(shù)據(jù)聚類分析一般包括以下幾個(gè)步驟:(1)確定基因表達(dá)的數(shù)據(jù);(2)計(jì)算相似性矩陣,各個(gè)矩陣元素代表兩個(gè)基因的表達(dá)是否相似;(3)選擇算法進(jìn)行聚類分析;(4)顯示分析結(jié)果。對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析之前,必須將包含在基因表達(dá)矩陣中的數(shù)據(jù)進(jìn)行相似程度分析,并且對(duì)分析結(jié)果進(jìn)行量化。

5 基因芯片聚類分析.png