廣州市黃埔區(qū)學(xué)大道攬?jiān)侣窂V州企業(yè)孵化器B座402
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項(xiàng)目名稱:Clip
所屬分類:IP類實(shí)驗(yàn)
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技術(shù)服務(wù)描述
Clip(crosslinking-immunprecipitation)染色質(zhì)免疫沉淀
Clip(crosslinking-immunprecipitation)染色質(zhì)免疫沉淀,是一項(xiàng)體內(nèi)研究RNA分子與RNA結(jié)合蛋白相互作用的革命性技術(shù)。其主要原理是基于RNA與其相應(yīng)的RNA結(jié)合蛋白會(huì)在紫外照射下會(huì)發(fā)生共價(jià)結(jié)合,以RNA結(jié)合蛋白的特異性抗體將RNA-蛋白復(fù)合物沉淀之后,回收其中的RNA片段,進(jìn)行qRT-PCR檢測或測序分析。最近,這項(xiàng)技術(shù)也被應(yīng)用于microRNA的靶標(biāo)鑒定。
服務(wù)優(yōu)勢
1經(jīng)紫外照射,細(xì)胞內(nèi)的RNA與相應(yīng)的RNA結(jié)合蛋白交聯(lián),增強(qiáng)RNA與蛋白的結(jié)合能力
2可檢測多種RNA,如LncRNA、mRNA、microRNA。
3可通過mRNA的差異表達(dá),檢測microRNA的靶標(biāo)mRNA。
4 PAR-Clip可精確定位RNA與蛋白的結(jié)合位點(diǎn)。
服務(wù)內(nèi)容
研究RNA與RNA結(jié)合蛋白的相互作用
研究microRNA的靶標(biāo)mRNA
服務(wù)流程
1狀態(tài)良好的細(xì)胞在356nm的紫外燈下照射一定時(shí)間
2收集細(xì)胞,制成蛋白提取液
3磁珠與抗體孵育
4帶有抗體的磁珠與蛋白提取液孵育
5清洗磁珠,加Trizol提取RNA,進(jìn)行qRT-PCR或測序分析
Clip與RIP的區(qū)別
Clip與RIP的共同點(diǎn):都是用于研究RNA與RNA結(jié)合蛋白互作的實(shí)驗(yàn)方法
Clip的優(yōu)勢:Clip與RIP的實(shí)驗(yàn)方法基本一致,Clip在細(xì)胞裂解前要經(jīng)過紫外的照射。活細(xì)胞經(jīng)紫外照射后,RNA與RNA結(jié)合蛋白會(huì)發(fā)生共價(jià)結(jié)合,結(jié)合能力強(qiáng)。而RIP細(xì)胞中的RNA與RNA結(jié)合蛋白通過氫鍵和范德華力結(jié)合,結(jié)合能力較弱。因此,RIP實(shí)驗(yàn)的洗脫過程中,會(huì)損失大量的RNA,而Clip實(shí)驗(yàn)有效的避免了這一點(diǎn)。
客戶提供
IP級別的蛋白抗體
所研究的細(xì)胞株
我們提供
qPCR原始數(shù)據(jù)及處理結(jié)果,測序分析原始數(shù)據(jù)及處理結(jié)果