廣州市黃埔區(qū)學(xué)大道攬?jiān)侣窂V州企業(yè)孵化器B座402
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Fax：020-85625352
QQ：386244141
項(xiàng)目名稱(chēng)：CHIRP
所屬分類(lèi)：IP類(lèi)實(shí)驗(yàn)
聯(lián)系電話：020-85625352
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技術(shù)服務(wù)描述
CHIRP(Chromatin Isolation by RNA Purification)是一種檢測(cè)與RNA綁定的DNA和蛋白相互作用的方法，可同時(shí)分析lncRNA/circRNA 、蛋白及DNA三者互作關(guān)系。利用ChIRP-seq技術(shù)可用于在全基因范圍內(nèi)定位lncRNA/circRNA的結(jié)合位點(diǎn)和可能結(jié)合的其他RNA分子,是揭示位于細(xì)胞核內(nèi)lncRNA/circRNA 生物學(xué)機(jī)制的關(guān)鍵實(shí)驗(yàn)手段。該方法是通過(guò)設(shè)計(jì)與目標(biāo)RNA序列反向互補(bǔ)的生物素探針，把目標(biāo)RNA拉下來(lái)以后，與其共同作用的DNA染色體片段就會(huì)附到鏈霉親和素磁珠上，最后通過(guò)qRT-PCR或測(cè)序來(lái)測(cè)定目的RNA、DNA序列，亦或是通過(guò)Western或質(zhì)譜分析來(lái)測(cè)定蛋白。
服務(wù)優(yōu)勢(shì)：
（1）、CHIRP實(shí)驗(yàn)可研究細(xì)胞體內(nèi)互作；
（2）、CHIRP實(shí)驗(yàn)既同時(shí)可研究RNA、蛋白質(zhì)和DNA形成的復(fù)合體之間的互作；也可研究它們之間的兩兩互作；
（3）、利用CHIRP-MS實(shí)驗(yàn)尋找與目的lncRNA結(jié)合的蛋白，可不受lncRNA長(zhǎng)度的限制；
（4）、利用CHIRP實(shí)驗(yàn)可研究circRNA與蛋白質(zhì)或DNA之間的互作。
服務(wù)內(nèi)容：
可用于研究RNA與DNA互作
可用于研究RNA與蛋白互作
可用于研究DNA與蛋白互作
服務(wù)流程：
（1）、CHIRP-RNA：探針設(shè)計(jì)與合成→細(xì)胞交聯(lián)→細(xì)胞裂解、超聲處理→探針雜交→復(fù)合物純化→RNA回收與純化→NGS或qRT-PCR檢測(cè)；
（2）、CHIRP-DNA：探針設(shè)計(jì)與合成→細(xì)胞交聯(lián)→細(xì)胞裂解、超聲處理→探針雜交→復(fù)合物純化→DNA回收與純化→NGS或qPCR檢測(cè)；
（3）、CHIRP-Protein：探針設(shè)計(jì)與合成→細(xì)胞交聯(lián)→細(xì)胞裂解、超聲處理→探針雜交→復(fù)合物純化→蛋白分離→質(zhì)譜鑒定。
客戶提供：
需要研究的RNA、DNA或蛋白名稱(chēng)及序列
所研究的細(xì)胞
我們提供：
實(shí)驗(yàn)報(bào)告（材料、試劑、儀器、方法、數(shù)據(jù)分析、實(shí)驗(yàn)結(jié)果）。
其他注意事項(xiàng)：
1、目標(biāo)lncRNA/circRNA的表達(dá)豐度：
2、如果目標(biāo)lncRNA/circRNA表達(dá)豐度較低，需要進(jìn)行過(guò)表達(dá)以確保ChIRP成功；