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項(xiàng)目名稱(chēng):lncRNA如何預(yù)測(cè)其靶基因?

所屬分類(lèi):生物信息學(xué)分析

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技術(shù)服務(wù)描述

lncRNA如何預(yù)測(cè)其靶基因?


??整個(gè)流程可以用兩句話總結(jié):將IP與input進(jìn)行callPeak的結(jié)果與已知lncRNA進(jìn)行相交,將交集得到的lncRNA進(jìn)一步查找其附近具有功能的Protein-coding基因,隨后對(duì)這些基因進(jìn)行功能富集分析。 如下圖所示,流程圖展示了如何使用RNA數(shù)據(jù)進(jìn)行l(wèi)ncRNA的查找與其靶基因功能注釋?zhuān)琁GV則將這個(gè)過(guò)程找到的基因進(jìn)行可視化。


流程圖示:


圖 4



IGV示意圖示:


圖 7