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項(xiàng)目名稱:mRNA實(shí)驗(yàn)建庫流程與分析流程(polyA 建庫)

所屬分類:生物信息學(xué)分析

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技術(shù)服務(wù)描述


建庫流程

??從RNA樣品提取到最終數(shù)據(jù)獲得,樣品檢測、建庫、測序等每一環(huán)節(jié)都會(huì)直接影響數(shù)據(jù)的數(shù)量和質(zhì)量,從而影響后續(xù)數(shù)據(jù)分析的結(jié)果。為從源頭保證測序數(shù)據(jù)準(zhǔn)確可靠,在數(shù)據(jù)的所有生產(chǎn)環(huán)節(jié)都嚴(yán)格把關(guān),從根源上確保高質(zhì)量數(shù)據(jù)的產(chǎn)出。建庫測序的流程如下所示:

  1. Total RNA 樣本檢測

  2. RNA 富集

  3. 雙鏈cDNA合成

  4. 末端修復(fù)、加A和接頭

  5. 片段選擇和 PCR 擴(kuò)增

  6. 文庫質(zhì)檢

  7. Illumina測序


分析流程

??RNA-seq的核心是基因表達(dá)差異的顯著性分析,使用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法,比較兩個(gè)條件或多個(gè)條件下的基因表達(dá)差異,從中找出與條件相關(guān)的特異性基因,然后進(jìn)一步分析這些特異性基因的生物學(xué)意義,分析過程包括質(zhì)控、比對、定量、差異顯著性分析、功能富集等環(huán)節(jié)。

圖 2