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產(chǎn)品名稱:RAP 試劑盒

品牌名稱:

所屬分類:RAP試劑盒

貨號(hào):KT106

規(guī)格:12 rxns;24 rxns;48 rxns

目錄價(jià)格:0 元

  • 產(chǎn)品描述
  • 品牌介紹
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  • RAP實(shí)驗(yàn)步驟

    注:實(shí)驗(yàn)全程環(huán)境為 Nuclease-free 環(huán)境,全過程須使用無 RNase 污染的實(shí)驗(yàn)用具和試劑,操作過程中也要防止 RNase 污染

    A 細(xì)胞裂解與染色體超聲斷裂

    1.向Cell lysis buffer(SCAP-1)中加入蛋白酶抑制劑和RNA 酶抑制劑,每mL加入12uL PMSF(SCAP-9)和10uL蛋白酶抑制劑(SCAP-8)和5uL RNase inhibitor(SCAP-10);

    2.在交聯(lián)的細(xì)胞沉淀中加入 1mL 含有蛋白酶抑制劑和RNA 酶抑制劑的 Lysis Buffer,吹打重懸并渦旋震蕩 15s,然后在4℃旋轉(zhuǎn)裂解1-2h;

    B 探針-RNA免疫沉淀

    1.取上述步驟所得上清液45μL至1.5mL離心管,儲(chǔ)存于-20℃,此為Input。

    2.取上述步驟所得上清液450μL至1.5mL或2mL的離心管中,加入2倍體積(即0.9mL)的Hybridization buffer(SCAP-2),并加入5uL RNase inhibitor(SCAP-10),并按每個(gè)反應(yīng)加入100pmol(約500~600ng)探針的量加入標(biāo)記的DNA探針,于37℃旋轉(zhuǎn)孵4h。

    3. 在探針與裂解液孵育將近4h時(shí)進(jìn)行磁珠預(yù)處理,即每個(gè)IP組取50uL鏈霉親和素磁珠(SCAP-7)只離心管中,于磁力架上靜置直到磁珠完全吸附到管壁上,吸除上清,再用500uL Lysis Buffer(SCAP-1)洗磁珠2次,吸除上清備用。

    4.探針與裂解液孵育4h后,轉(zhuǎn)移至處理好的磁珠管中,37℃旋轉(zhuǎn)孵30min。

    5.輕微離心后置于磁力架上待溶液澄清,棄掉上清液。

    6.加入1mL Wash Buffer(SCAP-3)在37℃旋轉(zhuǎn)洗5min,輕微離心后置于磁力架上待溶液澄清棄掉上清液。

    7.重復(fù)清洗5次。

    8.清洗好的磁珠每個(gè)IP組取1/10-1/5磁珠于新EP管中用于提取RNA,剩下的用于提取蛋白。Input組取等量(1/10-1/5)提取RNA。

    C RNA、蛋白的洗脫

    RNA洗脫(1/10-1/5):

    1.向磁珠中加入50uL PK buffer(SCAP-4)和5uL Proteinase K(SCAP-6),于65℃孵育45min,然后95℃孵育5min使DNA探針與目的RNA分開,迅速置于冰上,加入500uL的Trizol溶液渦旋振蕩10s,室溫靜置10min;input組直接加入500uL Trizol溶液提取RNA。

    2.再加入100 μL 氯仿,渦旋振蕩10s,在4℃,12000rpm離心15min后小心吸取上層水相至新的離心管中;

    3.加入2.5倍體積無水乙醇混勻(可選擇加入1-2uL糖原幫助沉淀,糖原可使用碧云天的)后置于-80℃沉淀過夜。

    4.第二天取出在4℃,12000rpm離心15min后小心去除上清,然后用75%乙醇清洗沉淀3次,最后一次盡量完全去除上清,開蓋晾干3min左右,用15uLRNase-free H2O溶解。

    蛋白的洗脫(剩余的磁珠和input):

    1.向磁珠中加入40uL elution buffer,100ug/mL RNase A和0.1U/uL RNase H,于37℃孵育30min;

    注:這里的RNase A和RNase H是終濃度。

    2.后加入10uL 5x蛋白Loading buffer,100℃煮10min后離心取上清于新的EP管中即為蛋白產(chǎn)物。蛋白產(chǎn)物可用于銀染,質(zhì)譜或WB檢測(cè)。

    1719822912162089355.pngRAP試劑盒